制药废水主要包括抗生素生产废水、合成药物生产废水、中成药生产废水以及各类制剂生产过程的洗涤水和冲洗废水四大类。其废水的特点是成分复杂、有机物含量高、毒性大、色度深和含盐量高，特别是生化性很差，且间歇排放，属难处理的工业废水。

随着我国医药工业的发展，制药废水已逐渐成为重要的污染源之一，如何处理该类废水是当今环境保护的一个难题。

化学制药的生产过程，由原料药生产和药物制剂生产组成，通过化学合成工艺和药用植物中分离提纯得到原料药。生产过程具有的特点是：物料净收率较低，副产品多，三废多，尤其是废水处理难度大。化学制药企业在工业生产中产生的废水具有有机物及无机盐含量高，BOD5和CODcr 比值低且波动大，可生化性很差，间歇排放，水量波动大等特点。

目前，针对于化学合成制药废水处理，处理方法可归纳为以下几种:化学处理方法、物化处理方法、生物处理方法以及多种方法的组合处理等。常用的主要还是用物化法、生化法结合处理，不过在处理之前，会先采用预处理对残留药物分子及抗生素活性进行有效的破坏及降解，这很有利于后续工艺的稳定进行，可大大的减少后续处理工序难度。